• Textilverstärkte Verbundkomponenten für funktionsintegrierende Mischbauweisen bei komplexen Leichtbauanwendungen (SFB 639)
  Sprecher: Prof. Dr.-Ing. habil. Werner Hufenbach, Fakultät Maschinenwesen
• • Transferbereich "Entwicklung und technologische Umsetzung von hochbeanspruchten Leichtbau-Modulträgern aus textilverstärkten Thermoplasten" im SFB 639
• Cells into tissues: Stem cell and progenitor commitment and interactions during tissue formation (SFB 655)
  Sprecher: Prof. Dr. med. Gerhard Ehninger, Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus
• Transzendenz und Gemeinsinn (SFB 804)
  Sprecher: Prof. Dr. phil. habil. Hans Vorländer, Philosophische Fakultät
  
• • Integriertes Graduiertenkolleg des SFB 804 "Transzendenz und Gemeinsinn" 
    Sprecher: Prof. Dr. phil. Gerd Schwerhoff
• Highly Adaptive Energy-Efficient Computing (SFB 912) 
  Sprecher: Prof. Dr. Gerhard Fettweis, Fakultät Elektrotechnik und Informationstechnik
  
  
• Volition und kognitive Kontrolle: Mechanismen, Modulatoren, Dysfunktionen (SFB 940) 
  Sprecher: Prof. Dr. Thomas Goschke, Fakultät Mathematik und Naturwissenschaften, FR Psychologie
  
• • Integriertes Graduiertenkolleg: Volition (VIRTU)
    Koordinatoren: Prof. Dr. Alexander Strobel und Prof. Dr. Clemens Kirschbaum, Fakultät Mathematik und Naturwissenschaften, FR Psychologie
• Großserienfähige Produktionstechnologien für leichmetall- und faser-verbundbasierte Komponenten mit integrierten Piezosensoren und –aktoren (PT-PIESA)  
  SFB-Transregio 39 (Standorte: Chemnitz, Dresden, Erlangen)
  Sprecher: Prof. Dr.-Ing. habil. Prof. E. h. Dr.-Ing. E. h. Dr. h. c. Reimund Neugebauer, Technische Universität Chemnitz
  Sprecher für den Standort Dresden: Prof. Dr.-Ing. habil. Werner Hufenbach, Fakultät Maschinenwesen
• Funktionelle Biomaterialien zur Steuerung von Heilungsprozessen in Knochen- und Hautgewebe - vom Material zur Klinik 
  SFB-Transregio 67 (Standorte: Leipzig, Dresden)
  Sprecher: Prof. Dr. Jan Christoph Simon, Universität Leipzig
  Sprecher für den Standort Dresden: Prof. Dr.-Ing. habil. Hartmut Worch, Fakultät Maschinenwesen
• • Integriertes Graduiertenkolleg "Matrixengineering"
      Sprecher für den Standort Dresden: Prof. Dieter Scharnweber
• Werkstoffe für die Hartgeweberegeneration im systemisch erkrankten Knochen
  SFB-Transregio 79 (Standorte: Gießen, Dresden, Heidelberg)
  Sprecher: Prof. Dr. Dr. Reinhard Schnettler, Justus-Liebig-Universität Gießen
  Sprecher für den Standort Dresden: Dr. rer. nat. Michael Gelinsky, Fakultät Maschinenwesen
• Molekulare Architektur und Zelluläre Funktionen von Lipid/Protein Komplexen
  SFB-Transregio 83 (Standorte: Heidelberg, Dresden, Bonn)
  Sprecher: Prof. Dr. rer. nat. Thomas Söllner, Universität Heidelberg
  Sprecherin für den Standort Dresden: Prof. Dr. rer. nat. Petra Schwille, BIOTEC
• Thermo-Energetische Gestaltung von Werkzeugmaschinen - Eine systemische Lösung des Zielkonflikts von Energieeinsatz, Genauigkeit und Produktivität am Beispiel der spanenden Fertigung
  SFB-Transregio 96 (Standorte: Dresden, Aachen, Chemnitz)
  Sprecher: Prof. Dr.-Ing. habil. Knut Großmann, Fakultät Maschinenwesen
  
  
• Biologie der xenogenen Zell- und Organtransplantation – vom Labor in die Klinik
  SFB-Transregio 127 (Standorte: München, Hannover, Dresden)
  Sprecher für den Standort Dresden: Prof. Dr. Bornstein, Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus
• 
  

beendete Sonderforschungsbereiche:

• Elektromagnetische Strömungsbeeinflussung in Metallurgie, Kristallzüchtung und Elektrochemie (SFB 609)
  Sprecher: Prof. Dr. rer. nat. habil. Stefan Odenbach, Fakultät Maschinenwesen
• Textile Bewehrungen zur bautechnischen Verstärkung und Instandsetzung" (SFB 528)  
  Sprecher: Prof. Dr.-Ing. Manfred Curbach, Fakultät Bauingenieurwesen
• • Transferbereich "Textile Bewehrungen zur bautechnischen Verstärkung und Instandsetzung"  im SFB 528
• Seltenerd-Übergangsmetallverbindungen: Struktur, Magnetismus und Transport (SFB 463) 
  Sprecher: Prof. Dr. rer. nat. habil. Clemens Laubschat, Fakultät Mathematik und Naturwissenschaften

• Institutionalität und Geschichtlichkeit (SFB 537) 
  Sprecher: Prof. Dr. phil. habil. Gert Melville, Philosophische Fakultät

• Membran-Mikrodomänen und ihre Rechte bei Erkrankungen des Menschen
  SFB-Transregio 13 (Teil DD) 
  Sprecherin bis Februar 2007: Prof. Dr. med. Ruth Strasser, Medizinische Fakultät Carl Gustav Carus
  Sprecher ab März 2007: Prof. Dr. Bernard Hoflack, Fachrichtung Biologie / BIOTEC