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Redaktion:
Petra Reuschel, Tel. 463-37587
Nachtrag HPC-Disk-Quotas
Wie in der letzten ZIH-Info angekündigt, sind im
Home-Dateisystem der HRSK-Rechner Disk-Quotas aktiviert. Der
dem Projekt bewilligte Speicherplatz ist als Soft-Quota
eingerichtet. Wird dieser Wert erreicht, dann akzeptiert das
Batch-System für das betroffene Projekt keine weiteren
Batch-Jobs. Ist die Soft-Quota um mehr als 10% überschritten,
können im Home-Verzeichnis keine neuen Dateien mehr angelegt
werden (Hard-Quota). Die Speicherplatzbelegung der Projekte im
Home-Dateisystem kann auf den HRSK-Maschinen mit Hilfe des
Programms „showquota“ abgefragt werden. Weitere Informationen
sind im HPC-Wiki unter https://doc.zih.tu-dresden.de/hpc-wiki/bin/view/Compendium/AnnouncementOfQuotas
zu finden. (Ansprechpartner: Holger Mickler, Tel.: -37903)
Upgrade des Voice-over-IP-Systems
Am 5. Juni 2012 wird auf dem zentralen Voice-over-IP-System die
neueste Version 8.6 des Cisco Unified Communications Manager
installiert. Betroffen sind davon ausschließlich die Telefone
im Gebäude Georg-Schumann-Str. 7a. Durch die Arbeiten kann es
ganztägig zu kurzen Ausfällen (jeweils maximal 5 Minuten) der
VoIP-Telefone kommen. Ab 15:00 Uhr ist auch mit längeren
Unterbrechungen zu rechnen, die vereinzelt auch zum Abbruch von
laufenden Gesprächen führen könnten. Das Upgrade ist
Voraussetzung für die geplante Aufrüstung des VoIP-Systems für
den Endausbau von ca. 10.000 Telefonen, die mit einer
vollständigen Virtualisierung der Serversysteme einhergehen
soll. (Ansprechpartner: Markus Gusowski, Tel.: -37820)
Installation CampusNet-Schulungssystem
Das Projekt zur Implementierung der SLM-Software CampusNet der
Firma Datenlotsen ist am 8. Mai 2012 mit dem Kick-Off offiziell
gestartet. In der ersten Projektphase liegt der Schwerpunkt auf
der Verfeinerung der Soll-Prozesse zu Ziel-Prozessen. Grundlage
dafür sind die regelmäßigen Key-User-Schulungen, in denen die
Projektmitarbeiter die Möglichkeiten der Prozessabläufe in der
Software kennenlernen. Dazu wurde am ZIH ein Schulungssystem
installiert. Auf fünf virtuellen Servern laufen in einer
Windows 2008-Domäne Dienste-Server für die Komponenten
Web-Zugriff, Datenbank und PDF-Generierung sowie ein
Terminal-Server. Dieser hat den Vorteil, den Key-Usern so
schnell wie möglich auch von ihrem Arbeitsplatz aus den Zugriff
auf CampusNet bereitzustellen. (Ansprechpartnerin: Korinna Trinckauf, Tel.:
-42253)
Schnellere RNA-Assemblierung mit Trinity
RNA-Sequenzierung wird zunehmend zur Untersuchung der
Genexpression von Organismen eingesetzt. Zur
de-novo-Rekonstruktion von Transkriptomen aus den
RNA-Sequenzdaten bietet die frei verfügbare Assembler-Software
Trinity eine sehr hohe Qualität, benötigt jedoch eine
vergleichsweise lange Rechenzeit. Im Rahmen des
Kooperationsabkommens zwischen der Indiana University (USA) und
dem ZIH wurde die Laufzeit von Trinity durch
Performance-Optimierungen und Parallelisierung deutlich
verringert, so dass eine mehr als dreimal so schnelle
Abarbeitung möglich ist. Der optimierte Quellcode wird mit der
nächsten Version von Trinity allen Nutzern zur Verfügung
gestellt. (Ansprechpartner: Matthias Lieber, Tel.: -35001)
Uni-Tag am 9. Juni 2012
Das ZIH ist zum diesjährigen Uni-Tag wiederum mit einem
Ausstellungsstand, ausgewählten Demonstrationen zur
wissenschaftlichen Arbeit und drei Vorträgen zum Thema
Supercomputer und deren Anwendungen präsent. Die Vorträge
„Anforderungen an Rechenzentren in Zeiten von Grid, Cloud &
HPC“ (Prof. Dr. Wolfgang E. Nagel), „Die Welt im Computer:
Simulationen auf Supercomputern“ (Dr. Ulf Markwardt, Dipl.-Inf.
(FH) Matthias Lieber, Dr. Matthias S. Müller) und „Modelle für
die Entstehung von Fingerabdrücken“ (Dr. Michael Kücken) finden
im Hörsaalzentrum, Bergstr. 64 statt. (Ansprechpartner:
Dietmar Augustin, Tel.:
-38559)
ZIH auf der ISC'12
Die International Supercomputing Conference (ISC, http://www.isc-events.com/isc12/ )
findet vom 18. bis 21. Juni 2012 in Hamburg statt. Neben
eigenen Forschungsaktivitäten auf dem Gebiet des
Hochleistungsrechnens wird das ZIH an seinem Stand (Nr. 120)
Ergebnisse verschiedener Anwenderprojekte vorstellen, die
auf den zentralen Hochleistungsrechnern durchgeführt werden.
Außerdem wird das Max- Planck-Institut für Klimaforschung in
Zusammenarbeit mit Alcatel Lucent, Hewlett-Packard und dem
ZIH die CMIP (Coupled Model Intercomparison Project)
Architektur des World Climate Research Programme (WCRP)
nachbilden. Im CMIP-Umfeld werden Daten aus sehr vielen
Knoten zur Berechnung zusammengeführt. Für die ISC werden
die Daten auf Modellgröße reduziert. Eine von vier
Workstations wird auf dem ZIH-Stand aufgebaut, insgesamt
werden zwei Datenknoten, ein Gateway-Knoten und ein Knoten
zur Berechnung an der Demonstration teilnehmen.
(Ansprechpartner: Michael Kluge, Tel.: -34217)
ZIH-Kolloquium
Am 28. Juni 2012 um 15:00 Uhr lädt das ZIH zum Kolloquium in
den Willers-Bau A 317 ein. Herr Prof. Dr. Bertil Schmidt von
der Universität Mainz wird einen Vortrag zum Thema „Parallel
Algorithms and Tools for Bioinformatics on GPUs“ halten.
(Ansprechpartner: Dr. Ralph Müller-Pfefferkorn, Tel.:
-39280)
Campus 2020: Finaler Wettbewerb
Der erste Ideenwettbewerb „Campus 2020“, der an der TU Dresden
durch das ZIH koordiniert wird, ist auf der Zielgeraden. Am 11.
Juni 2012 finden ab 9:30 Uhr im Willers-Bau C207 die
Abschlusspräsentationen zum Thema Zugangs- und Schließsysteme
statt. Die besten Ideen werden direkt im Anschluss von der Jury
aus Vertretern der TU Dresden und der T-Systems Multimedia
Solutions GmbH (MMS) prämiert. Auf die Gewinner warten
Preisgelder in Höhe von insgesamt 3.000 Euro, die von der MMS
bereitgestellt werden. Das Studentenwerk Dresden sponsert
außerdem Mensagutscheine. Die Präsentationen und die
Preisverleihung sind öffentlich: Gäste sind zu dieser
Veranstaltung herzlich eingeladen! Weitere Informationen unter
http://tu-dresden.de/campus-2020
(Ansprechpartnerin: Jacqueline Papperitz, Tel.:
-32431)
Workshop COLMOTBIO 2012
Am Zentrum für interdisziplinäre Forschung (ZiF) der
Universität Bielefeld findet vom 5. bis 9. November 2012 der
Workshop „Collective motion in biological systems: from data to
models” (COLMOTBIO 2012) statt. Kollektive Bewegungsphänomene
(z. B. die Bewegung von Schwärmen) markieren ein hochaktuelles
interdisziplinäres Forschungsthema, das auch am ZIH in
verschiedenen Forschungsprojekten untersucht wird.
Selbstorganisierte Schwarmbewegung ist in der Biologie
universell und lässt sich auf molekularer, zellulärer und
organismischer Ebene beobachten. Schwarmphänomene liefern
wichtige Beispiele für globale Strukturbildung als Ergebnis
lokaler Interaktion. Für die Analyse sind mathematische
Modellierung und Simulation unerlässlich. Ziel des Workshops
ist die Diskussion neuester biologischer Daten und
entsprechender Modelle. Die Organisatoren dieses Workshops sind
das Research Center on Animal Cognition der Universität Paul
Sabatier Toulouse, das Biological Physics Department der Eötvös
Universität Budapest und das ZIH der TU Dresden.
(Ansprechpartner: Prof. Dr. Andreas Deutsch, Tel.:
-31943)
Neue ZIH-Publikationen
D. Molka, R. Schöne, D. Hackenberg, M. S. Müller:
Memory Performance and SPEC OpenMP Scalability on Quad-Socket
x86_64 Systems (ZIH-IR-1133)
In Algorithms and Architectures for Parallel Process-ing,
Lecture Notes in Computer Science, Vol. 7016, Springer,
2011
Veranstaltungen
- 5.6.2012, 9:00 - 12:00 Uhr, Willers-Bau A 220:
„E-Ressourcen der SLUB – effektiv genutzt?“
- 6.6.2012, 9:00 - 13:00 Uhr, Willers-Bau A 220:
„E-Mail- und Terminmanagement mit Outlook und OWA“
- 8.6.2012, 9:20 - 11:50 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
Schulungsreihe E-Learning „OPAL-Basiskurs“
- 9.6.2012, 9:30 - 15:00 Uhr, HSZ, Bergstr. 64:
Uni-Tag: Tag der offenen Tür
- 14.6.2012, 9:00 - 17:00 Uhr, Willers-Bau A 220:
„Präsentationen und Poster mit LaTeX erstellen“
- 15.6.2012, 9:20 - 11:20 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
Schulungsreihe E-Learning „OPAL-Testen mit Onyx“
- 19.6.2012, 8:30 - 16:00 Uhr, Willers-Bau A
220:
„Einstieg in die Programmierung“
- 20.6.2012, 9:30 - 11:00 Uhr, Willers-Bau A 220:
„Security – Firewall (Grundlagen und Konzepte)“
- 21.6.2012, 10:00 - 15:00 Uhr, Willers-Bau A 220:
„Einführung in das Datennetz der TU Dresden“
- 22.6.2012, 9:20 - 12:40 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„Basiskurs Web-Redaktionssystem (TUDWCMS)“
- 28.6.2012, 15:00 Uhr, Willers-Bau A 317:
ZIH-Kolloquium: „Parallel Algorithms and Tools for
Bioinformatics on GPUs“, Prof. Dr. Bertil Schmidt (Universität
Mainz)
http://www.tu-dresden.de/zih/veranstaltungen
servicedesk@tu-dresden.de