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Redaktion:
Petra Reuschel, Tel. 463-37587
Wartungsarbeiten am zentralen E-Mail-System
Das ZIH nimmt neue und schnellere Festplattenspeicher für die
zentralen Nutzer-Mailboxen in Betrieb. Die Migration auf das
neue System erfolgt vom 20. August 2011, 18:00 Uhr bis 21.
August 2011, 12:00 Uhr. In dieser Zeit ist der Server
mail.zih.tu-dresden.de nicht erreichbar und somit das Senden
und Empfangen von E-Mails nicht möglich. Die Nutzung des
Webportals https://mail.zih.tu-dresden.de
(Horde-Webmail) ist somit auch nicht möglich. Im genannten
Zeitraum eintreffende Mails gehen nicht verloren, sondern
werden anschließend zugestellt und Weiterleitungen danach
ausgeführt. Fragen im Vorfeld bitte per Mail an die
Benutzerberatung, 
beratung@zih.tu-dresden.de.
(Ansprechpartner: Steffen Petrick, Tel.: -32305)
IDM-Kooperation mit der Universität Leipzig
Das Projekt Identitätsmanagement (IDM) hat eine weitere
wichtige Etappe erreicht. Die Ausschreibung für die benötigte
Software zur technischen Umsetzung eines zentralen
Identitätsmanagements ist im Supplement zum Amtsblatt der
Europäischen Union (TED) erschienen. Das offene Verfahren läuft
bis Ende Juli 2011. Ausgeschrieben werden neben der Anschaffung
einer geeigneten Software auch Schulungs- und
Beratungsleistungen für die Implementierung.
Die Universität Leipzig und die TU Dresden haben eine
langfristig angelegte Kooperationsvereinbarung im Bereich
Identitätsmanagement geschlossen. Die Beschaffung ist die erste
gemeinsame Aktivität auf Basis dieser Vereinbarung und wird von
der Universität Leipzig geführt, wobei die fachlichen Teile von
beiden Universitäten gleichermaßen betreut werden. Mit dem
gewählten Anbieter soll eine Rahmenvereinbarung geschlossen
werden, die es gestattet, dass weitere sächsische Hochschulen
beitreten können. Nach Zuschlagserteilung werden die beiden
größten sächsischen Universitäten auch bei der Einführung sowie
dem produktiven Betrieb eng zusammenarbeiten. (Ansprechpartner:
Stefan Woithe, Tel.: -38721)
Genomanalyse trifft HPC
Die Lebenswissenschaften untersuchen komplexe Abläufe auf
molekularer und zellulärer Ebene und ermöglichen so neuartige
medizinische Therapien. Die Basis zur Erforschung vieler
Fragestellungen sind Genomsequenzen menschlicher Individuen und
anderer Organismen. Mit modernen NGS-Sequenziertechnologien
(Next Generation Sequencing) können diese in immer kürzerer
Zeit entschlüsselt werden. Das Zusammensetzen der kleinen
Genomsequenzen, die von den Sequenzierern produziert werden,
sowie weitere anwendungsspezifische Analysen stellen einen
enormen Engpass in den wissenschaftlichen und klinischen
Arbeitsumgebungen dar, da aktuelle Software den steigenden
Datenmengen nicht mehr gerecht werden kann. An diesem Punkt
setzt das für drei Jahre vom BMBF geförderte Projekt NGSgoesHPC
an. Ziel ist es, die für die Datenanalyse entscheidenden
Anwendungen durch die effiziente Nutzung moderner
Hochleistungsrechner zu beschleunigen und so zukünftig neue
Möglichkeiten in diesem Forschungsbereich zu ermöglichen. Das
ZIH arbeitet eng mit den Partnern an der Entwicklung
hochoptimierter und parallelisierter Algorithmen zusammen und
bündelt die Entwicklungen in einer Open-Source-Bibliothek, die
den Biologen zur Verfügung gestellt werden soll. Die weiteren
Projektpartner sind die Universität zu Köln, das BIOTEC der TU
Dresden, das Max-Planck-Institut für Biologie des Alterns, die
ATLAS Biolabs GmbH, die Bull GmbH und das Forschungszentrum
Jülich. (Ansprechpartner: Matthias Lieber , Tel.:
-31945)
Sonderforschungsbereich 912 startet
Am 1. Juli 2011 begann der SFB „HAEC – Highly Adaptive
Energy-Efficient Computing“ der TU Dresden (Sprecher: Prof. Dr.
Gerhard P. Fettweis) mit seiner Arbeit. Dabei werden in enger
Verflechtung von Hardware- und Software-Entwicklung neue
Technologien erforscht, um künftige Computersysteme ohne
Leistungseinbußen energieeffizient zu betreiben. Das Spektrum
der Forschungsprojekte reicht von Halbleitertechnologien über
neuartige optische und drahtlose Kommunikation bis hin zu
adaptiven Betriebssystemen und „energiebewusster“ Software. Das
ZIH ist verantwortlich für Entwicklung eines Simulators für die
„HAEC-Box“. Er verbindet Modelle für Hardware, Software,
Kommunikation und Energie miteinander und ermöglicht damit
ganzheitliche Untersuchungen und Prognosen für das
Zusammenspiel der in den Einzelprojekten entwickelten
Technologien und Modelle. Ein weiteres Forschungsziel des ZIH
umfasst die feingranulare Messung, Analyse und Modellierung des
Energieverbrauchs einzelner Rechnerkomponenten (CPU, RAM,
Netzwerk) in Abhängigkeit von konkreten Berechnungen,
Speicherzugriffen usw. Andere Forschergruppen benutzen dieses
Energiemodell zum Beispiel für die Zuteilung und Taktung von
Systemressourcen oder um den Energieverbrauch von Software zu
bewerten. (Ansprechpartner: Dr. Ulf Markwardt, Tel.:
-33640)
Netzwerk „Hirntumore“ in Dresden
Das im Jahr 2010 gegründete fachübergreifende Netzwerk
„Hirntumore“ (bestehend aus Forschern und Ärzten des Dresdner
Universitätsklinikums und der Technischen Universität)
veranstaltete kürzlich seine zweite Klausurtagung. Mit
Beteiligung des ZIH ging es u. a. um den verstärkten Einsatz
systembiologischer Methoden und mathematischer Modellierung zur
Untersuchung zentraler Fragen der Tumorprogression. Unter dem
Dach des Universitäts Krebs-Centrums Dresden (UCC) werden nun
die aktuellen Forschungsprojekte gebündelt. Deren Ergebnisse
sollen künftig noch schneller dem Patienten helfen.
(Ansprechpartner: Prof. Dr. Andreas Deutsch, Tel.:
-31943)
ZIH-Kolloquium
Am 25. August 2011 um 15:00 Uhr lädt das ZIH zum Kolloquium in
den Willers-Bau A 317 ein. Herr Dr. Georg Hager vom Regionalen
Rechenzentrum der Friedrich-Alexander Universität
Erlangen-Nürnberg wird einen Vortrag zum Thema „Monitoring,
Accounting und Nutzerverwaltung auf den HPC-Systemen des RRZE“
halten. (Ansprechpartnerin: Dr. Stefanie Maletti, Tel.:
-34184)
ZIH auf der ISC'11
Vom 19. bis 23. Juni 2011 fand die International Supercomputing
Conference (ISC, www.supercomp.de) in Hamburg statt.
Dabei wurde traditionell wieder die Liste der 500
schnellsten Rechner der Welt aktualisiert. Bezogen auf die
Rechenleistung dominieren innerhalb der ersten zehn Plätze
derzeit Systeme aus China und Japan diese Liste. Neben
eigenen Forschungsaktivitäten auf dem Gebiet des
Hochleistungsrechnens hat das ZIH an seinem Stand Ergebnisse
verschiedener Anwenderprojekte vorgestellt, die auf den
zentralen Hochleistungsrechnern durchgeführt werden. Ein
wichtiger Bestandteil der Präsentation ist das am ZIH
entwickelte Werkzeug Vampir zur interaktiven
Performance-Analyse. Weiterhin berei-cherte die Firma
Simunova, eine Ausgründung der TU Dresden, den Stand mit
ihrem Motto „All you can compute“ und stellte ihre für
HPC-Anwendungsfälle entworfene Matrix Template Library vor.
(Ansprechpartner: Michael Kluge, Tel.: -34217)
Neue ZIH-Publikationen
H. Burau, R. Widera, W.
Hönig, G. Juckeland, A. Debus, T. Kluge, U. Schramm, T.E.
Cowan, R. Sauerbrey, M. Bussmann:
PIConGPU: A Fully Relativistic Particle-in-Cell Code for a GPU
Cluster (ZIH-IR-1027)
In Plasma Science, IEEE Transactions, Vol. 38, Nr. 10,
IEEEXplore Digital Library
W. Hönig , F. Schmitt, R. Widera, H. Burau, G. Juckeland, M. S.
Müller, M. Bussmann:
A Generic Approach for Developing Highly Scalable Particle-Mesh
Codes for GPUs (ZIH-IR-1028)
In Extended Abstract at 2010 Symposium on Application
Accelerators in High Performance Computing (SAAHPC'10),
Knoxville, USA
Veranstaltungen
- 8.7.2011, 9:20 - 11:50 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„OPAL-Basiskurs“
- 13.7. - 14.7.2011, 8:00 - 16:00 Uhr, Willers-Bau A
220:
„Linux-Grundlagen – Schneller Start mit Linux“
- 15.7.2011, 8:00 - 16:00 Uhr, Willers-Bau A 220:
„Samba 3.5.x“
- 15.7.2011, 9:20 - 10:50 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„Aufbaukurs Web-Redaktionssystem (TUDWCMS)“
- 21.7. - 22.7.2011, 8:00 - 15:00 Uhr, Willers-Bau A
220:
„Excel 2003 – Einführung“
- 22.7.2011, 9:20 - 12:40 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„Basiskurs Web-Redaktionssystem (TUDWCMS)“
- 12.8.2011, 9:20 - 11:50 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„OPAL-Basiskurs“
- 19.8.2011, 9:20 - 11:50 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„OPAL-Aufbaukurs“
- 25.8.2011, 15:00 Uhr, Willers-Bau A 317:
ZIH-Kolloquium: „Monitoring, Accounting und Nutzerverwaltung
auf den HPC-Systemen des RRZE”, Dr. Georg Hager (RRZE,
Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg)
- 26.8.2011, 9:20 - 12:40 Uhr, PC-Pool WEB 1 (MZ):
„Basiskurs Web-Redaktionssystem (TUDWCMS)“
- 6.9. - 7.9.2011, 8:00 - 16:00 Uhr, Willers-Bau A
220:
„Windows XP bis Windows 7“
http://www.tu-dresden.de/zih/veranstaltungen
